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二代測序一、測序原理: 二代測序以能一次并行對幾十萬到幾百萬DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標志。使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能。 華大二代測序儀核心技術采用線性擴增,提高數(shù)據獲得效率,減少反應過程的誤差,零錯誤積累,效率高,檢測準確度高,反應時間短。 二 、服務項目: 1、轉錄組測序 全面快速地獲取某一物種特定器官或組織在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉錄本,可以選定某個特定時期的所有轉錄產物。能觀測到包括包括總RNA和小RNA(miRNA、tRNA和核糖體RNA)在內不同尺度的RNA表達譜。RNA測序還能用來確定外顯子/內含子的邊界,修正之前注釋的5'和3'端基因邊界。 應用領域:哺乳動物組織轉錄組分析 腫瘤和其他疾病的發(fā)生和發(fā)展研究 植物生長過程中細胞的基因表達模式的變化分析 抗逆、抗病蟲害調控機理的研究 2、擴增子測序 對環(huán)境樣本物種分類及豐度,種群結構,系統(tǒng)進化,群落比較等方面信息進行分析的研究方法 應用領域:人體微生物與人體健康/疾病的關系,人體微生物對疾病干預過程的影響; 腸道、瘤胃(如產甲烷菌類群)與動物健康/營養(yǎng)消化研究等; 根際微生物與植物互作、農業(yè)耕作/施肥處理與土壤微生物群落等; 霧霾處理、污水治理、石油降解、酸性礦水處理及海洋環(huán)境等; 3、16S/18S/ITS測序及宏基因組測序 16S/18S/ITS測序通過提取環(huán)境樣品的DNA,選擇合適的通用引物擴增某一或某幾個區(qū),通過檢測目的區(qū)域的序列變異和豐度,對環(huán)境樣本物種分類及,豐度,種群結構,系統(tǒng)進化,群落比較等方面信息進行分析的研究方法。應用范圍廣、檢測區(qū)域多(可同時檢測V3、V4、和V5三個可變區(qū)域)、讀長更長、周期短、自動化平臺分析。 應用領域:醫(yī)學領域:人體微生物與人體健康/疾病的關系,人體微生物對疾病干預過程的影響; 動物領域:腸道、瘤胃(如產甲烷菌類群)與動物健康/營養(yǎng)消化研究等; 農業(yè)領域:根際微生物與植物互作、農業(yè)耕作/施肥處理與土壤微生物群落等 環(huán)境領域:霧霾處理、污水治理、石油降解、酸性礦水處理及海洋環(huán)境等; 特殊極端環(huán)境:極端環(huán)境條件下的微生物類群研究,如冰川、火山等。 4、高通量包lane測序服務 為科研工作者提供各個環(huán)節(jié)的高通量測序服務,根據客戶需求制定優(yōu)化實驗流程,改善實驗方案,滿足客戶對實驗數(shù)據分析處理的需求。 三、服務優(yōu)勢: 實驗嚴謹:建庫工藝穩(wěn)定,技術重復性高。 經驗豐富:有豐富的項目經驗。 專業(yè)團隊:有專門團隊負責,提供切實可行的項目方案。 上一篇質譜檢測 |